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私見ですが、詳細は解かりませんので、
あくまでも文面から読み取れることのみを判断材料としてアドバイス致します。

「境界票を打ったブロック塀に隣接する擁壁や塀は法律上問題があるのでしょうか？」
無いと思います。

「了承していだくようにできますでしょうか？」
お願いするしか無いと思います。
一般的には、施工業者が挨拶致します。
ところで、隣地所有者がブロックを積んだ時は、貴方の土地に入らなかったのですか。
お互い様だと思いますよ。

「隣家は以前は市役所勤務の退職者で」
これは、全く気にする必要は御座いません。
民民の問題はあくまでも民間人同士の問題です。

境界の問題は、
「私共は隣家とこれ以上モメるのも嫌なので，以降黙認するような形となり」
となった時点で、負けを認めた様なものです。
気を引き締め、負けないぞと言う気持ちで、頑張って下さい。